Эффективность чистого помещения, а также выполнение его задач, зависят от различных факторов в проекте, таких как размещение оборудования, использование приточных фильтров и вытяжек. Важным аспектом является также учет тепловыделений, воздействие персонала и материалов, влияющих на направление потоков воздуха.
Для определения характеристик потока воздуха, таких как его вид, форма, направление и скорость, применяются два основных метода моделирования: физическое и численное компьютерное моделирование. Физическое моделирование может стать обязательным этапом при аттестации уже построенного помещения, особенно в ответственных областях, таких как асептическое производство. Существует несколько методов, отличающихся сложностью, для проведения такого моделирования.